在污水處理系統中一定的范圍內，微生物會受到溫度的影響。同樣，對厭氧技術追求高的環保技術人員，對于厭氧池的溫度一般控制在中溫厭氧的情況下為35-36度。但溫度一旦過低或過高，會產生很直觀的影響就是污水處理效率過低。

隨著溫度的升高，雖然不利于氧向水中的轉移，卻可以加快生化反應速率，但由于微生物細胞組織中的蛋白質、核酸等對溫度變化速率很敏感，當溫度突然升高的時候，升高的速率超過一定的限度時，就會產生蛋白質以及核算的不可逆破壞，導致污水處理效果變差。

相比之下，厭氧溫度降低，氧向水中轉移逐漸增加，厭氧池中溶解氧增加，厭氧處理效果低。

相比之下，對于好氧池來說。水溫對氧的轉移影響較大，水溫上升，水的粘滯性降低，擴散系數提高，液膜厚度隨之降低，KLa值增高，這會促進氧轉移。水溫降低有利于氧的轉移，從而就導致溶解氧增多，好氧池出水效果變好。水溫升高，即使增大鼓風機曝氣量，水溫高，溶解氧就會降低。舉個例子，就好像我們為什么將自來水煮沸才喝，就是對自來水的加熱從而達到蒸發自來水中的氯氣的效果，以免氯氣含量過多中毒。同時也會對微生物組織的蛋白質、核酸等進行破壞，從而導致微生物死亡的情況出現。

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